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ARNs de unión a proteínas

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De hecho, soy un biólogo computacional, perdóneme si la descripción de mi pregunta es un poco fuera de lugar, mi curiosidad me está impulsando

Un poco de trasfondo y contexto: En las bacterias, una proteína reguladora denominada CsrA se une a ciertas estructuras en las regiones UTR de los genes e impide su traducción. Estas estructuras son cortas en forma de horquilla y todas tienen nucleótidos AGGA en la parte expuesta. Hay ARNs que aíslan la proteína de sus objetivos, una característica común de estos ARNs es que tienen varias horquillas repetitivas que muestran más o menos nucleótidos AGGA en la parte expuesta. Entonces, básicamente, los ARNs imitan las estructuras en los objetivos de las proteínas y eso los convierte en potentes competidores para la unión de proteínas contra los genes que realmente son el objetivo de la proteína. Al confiar en este mimetismo, los ARNs se unen a CsrA, lo aíslan de sus objetivos y eliminan su supresión de la traducción de genes.

Mi pregunta: ¿Existen otros ejemplos que ilustren mecanismos similares de analogía / imitación de ARNs para unir proteínas?

Lo que intenté He hojeado mucha literatura para identificar otros sistemas similares en bacterias donde los ARNs han conservado estructuras repetitivas, pero fue en vano. Espero que alguien con una experiencia más profunda me dirija a tales ejemplos en cualquier organismo vivo, preferiblemente bacterias, pero estoy abierto a sugerencias. Encontré CRISPR, pero estos están basados ​​en ADN, me he encontrado con algunos otros ARNs de acción cis que se dirigen a ARNm y no se unen a proteínas. Entonces, ¿podría ser el caso de que los imitadores de ARNs no sean muy penetrantes en las bacterias después de todo?


La regulación mediada por ARNs en bacterias opera a través de diversos mecanismos. Este caso de ARNm que compite con un ARNm por una proteína es un tipo de regulación pasiva. Esto puede ser bueno para el ajuste fino, pero puede que no sea muy eficaz. Es mucho mejor regular activamente un ARNm mediante unión directa. Además, solo funcionará si la proteína en cuestión se encuentra en concentraciones limitantes.

No he encontrado ningún ejemplo de lo que le interesa. Puede haber una situación similar en el caso de un sistema eucariota. Los miARN se pueden valorar mediante ARN largos que portan múltiples sitios de unión para ese miARN, lo que hace que los miARN no estén disponibles para unirse al ARNm diana. Estos ARN largos se denominan ceRNA (ARN endógeno competitivo) o esponjas de miARN (este término se usa principalmente si el ARN es exógeno). Sin embargo, esta no es realmente una interacción proteína-ARN a pesar de que el complejo RISC contiene proteínas.


Ver el vídeo: El Dogma Central de la Biología: ADN, ARN y Proteínas. (Agosto 2022).