Información

29.6: Mamíferos - Biología

29.6: Mamíferos - Biología


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

29.6: Mamíferos

DoubletDecon: Deconvoluting Doublets a partir de datos de secuenciación de ARN de una sola celda

Los métodos de secuenciación de ARN unicelular (scRNA-seq) han avanzado mucho en los últimos años. Si bien los métodos basados ​​en gotas y en pozos han aumentado la frecuencia de captura de las células para scRNA-seq, estas tecnologías producen fácilmente artefactos técnicos, como las capturas de células dobles. Los dobletes que se producen entre distintos tipos de células pueden aparecer como perfiles híbridos de scRNA-seq, pero no tienen transcriptomas distintos de estados de células individuales. Presentamos DoubletDecon, un enfoque que detecta los dobletes con una combinación de análisis de deconvolución y la identificación de la expresión génica del estado celular único. Demostramos la capacidad de DoubletDecon para identificar dobletes de células sintéticas, de especies mixtas, genéticas y de hash de células a partir de conjuntos de datos de scRNA-seq de complejidad celular variable con una alta sensibilidad en relación con enfoques alternativos. Es importante destacar que este algoritmo evita la predicción de estados de células de transición y de linaje mixto válidos como dobletes al considerar su expresión genética única. DoubletDecon tiene una interfaz gráfica de usuario fácil de usar y es compatible con diversas especies y algoritmos de detección de población no supervisados.

Palabras clave: RNA-seq detección de artefactos bioinformática deconvolución doblete multiplete RNA-seq de una sola célula.

Copyright © 2019 Los Autores. Publicado por Elsevier Inc. Todos los derechos reservados.


David Weisrock

La investigación en el laboratorio Weisrock combina genética, genómica y biología evolutiva. Gran parte de nuestra investigación se centra en el uso de la genética para resolver los límites geográficos de las especies en la naturaleza, reconstruir las relaciones entre estos linajes y abordar los mecanismos que han llevado a su formación. A nivel de población, nuestra investigación busca comprender los factores adaptativos y no adaptativos que influyen en el flujo de genes e impulsan la especiación. A un nivel más macroevolucionario, utilizamos enfoques filogenéticos para resolver la historia evolutiva de los conjuntos de especies e inferir las tasas a las que se forman.

Los proyectos de investigación en nuestro laboratorio cubren una amplia gama taxonómica, desde la especiación en salamandras tigre norteamericanas hasta la diversificación evolutiva en lémures malgaches. El advenimiento de la genómica ha sido especialmente valioso para nuestra investigación y centramos cada vez más nuestros esfuerzos en enfoques analíticos que permitan resumir la información genética poblacional y filogenética de todo el genoma. Como complemento de este enfoque, forjamos colaboraciones estrechas con colegas en Estadística para desarrollar nuevos enfoques analíticos aplicables a datos de múltiples locus.

Para obtener más información sobre los miembros del laboratorio y su investigación, visite el Sitio web de Weisrock Lab.


Mamíferos carnívoros: digestibilidad de nutrientes y evaluación energética

La estimación del contenido energético es el primer paso en la formulación de la dieta, ya que determina la cantidad de alimento ingerido y, por tanto, la concentración de nutrientes necesaria para satisfacer las necesidades del animal. Además, ser capaz de estimar el contenido energético de una dieta que se sabe empíricamente mantiene la condición corporal en un animal facilitará una estimación de las necesidades energéticas de mantenimiento. Recopilamos datos sobre la composición de nutrientes de las dietas alimentadas a cánidos, félidos, hienidas, mustélidos, pinnípedos y ursidos silvestres en cautiverio y los coeficientes de digestibilidad de la literatura (45 especies, 74 publicaciones) para probar si se podían detectar diferencias en la digestibilidad de proteínas y grasas. entre grupos de especies, y si los enfoques sugeridos para la estimación del contenido de energía metabolizable en la dieta (EM) en carnívoros domésticos (NRC [2006] Requerimientos de nutrientes de perros y gatos. Washington, DC: National Academy Press.) se pueden aplicar a los carnívoros silvestres como bien. Las regresiones del contenido de proteína o grasa digestible frente al contenido de proteína cruda (PC) o grasa no indicaron diferencias relevantes en la fisiología digestiva entre los grupos de carnívoros. Para las dietas basadas en carne cruda, pescado o presas enteras, la aplicación del cálculo de EM utilizando "factores de agua" (16,7 kJ / g CP 16,7 kJ / g extractos libres de nitrógeno 37,7 kJ / g de grasa cruda) proporcionó estimaciones que se compararon bien con resultados experimentales. Este estudio sugiere que la estimación de EM en tales dietas es factible sin ensayos de digestión adicionales. Para la investigación de nutrición comparativa, el estudio implica que las dietas altamente digestibles que normalmente se administran en zoológicos ofrecen poco potencial para dilucidar las diferencias entre especies o grupos de carnívoros, pero falta investigación sobre dietas con proporciones más altas de componentes difíciles de digerir (fibra, tejidos conectivos). . Zoo Biol 29: 687–704, 2010. © 2010 Wiley-Liss, Inc.


Contenido

Amy Gladfelter se formó en la Universidad de Princeton (AB) con Bonnie Bassler, Duke University (Ph.D.) con Daniel Lew y UniBasel Biozentrum (post-doc) con Peter Philippsen antes de comenzar su carrera independiente en Dartmouth en el departamento de Ciencias Biológicas en 2006, donde estuvo hasta 2016.

Los dos principales enfoques de investigación del laboratorio de Gladfelter son cómo se organiza espacialmente el citoplasma y cómo las células perciben su propia geometría. Su equipo utiliza una variedad de sistemas modelo para estudiar los sincitios, que incluyen Ashbya gossypii, Neurospora crassa, miotubos y el sincitiotrofoblasto de la placenta humana para estudiar la arquitectura del citoplasma. Gladfelter también está buscando nuevos sistemas de hongos derivados del medio marino que sean extremófilos y muestren características morfológicas celulares que no se encuentran en sistemas de modelos más convencionales. [15]

Gladfelter hizo el descubrimiento de que en el hongo multinucleado Ashbya gossypii, a pesar de que los núcleos comparten el mismo citoplasma, avanzan a través del ciclo celular de forma independiente entre sí. [16] Esto ha llevado a un trabajo adicional para descubrir cómo la separación de fase líquido-líquido de ARN y proteínas puede permitir que los núcleos sincitiales sean autónomos y permitir que se establezca la polaridad celular. Recientemente, el laboratorio ha comenzado a examinar la separación de fases en el contexto de la infección por SARS CoV-2 y se centra en comprender los mecanismos del empaquetamiento viral.

Otra área que explora el laboratorio de Gladfelter es cómo las células perciben su forma. [5] Gladfelter y su laboratorio han estudiado extensamente el papel de la familia conservada de proteínas llamadas septinas, que se localizan en áreas de la célula que cambian de forma o están muy curvadas, en la detección de curvatura. [17] [18] [19]


El laboratorio marrón


Nuestro laboratorio está muy interesado en la evolución de la socialidad en microbios. Estamos desarrollando sistemas modelo para observar los puntos en común entre los mayores ejemplos de evolución convergente conocidos hasta la fecha. Hemos descubierto que una gran diversidad de microbios eucariotas unicelulares (también conocidos como protistas) son capaces de trabajar entre sí para formar un cuerpo complejo formado por miles de células individuales. Este es uno de los ejemplos más simples y sorprendentes de comportamiento emergente. En muchos casos, este comportamiento es sacrificatorio cuando algunas de las células que se convierten en parte del cuerpo multicelular mueren por el "bien de los demás" de sus parientes. Para examinar las similitudes entre los diversos protistas sociales, estamos adoptando un enfoque de múltiples frentes utilizando la genómica comparativa y la transcriptómica del desarrollo para dilucidar la base genética de la socialidad.

Nuestro laboratorio también está interesado en examinar la evolución profunda de los linajes eucariotas. Estamos utilizando enfoques novedosos en filogenómica para examinar cómo evolucionaron los diversos grupos principales de eucariotas en el transcurso del último

2 mil millones de años. Actualmente nos centramos en las historias evolutivas de los organismos ameboides.

PhyloFisher: un paquete filogenéticamente consciente para la filogenómica Presentado por Matthew Brown PhD el 14/05/2020 como parte de la serie de seminarios de protista genómica.
https://www.youtube.com/watch?v=TcKhLiUxBTU&t=1s

Publicaciones
^ becario de pregrado, + becario de posgrado, * becario de postdoctorado
@ = Revisado por pares, $ = revisión editorial,

En revisión o enviado
Tice AK +, Žihala D, P & aacutenek T *, Jones RE +, Salomaki E, Nenarokov S, Burki F, Eli & aacute & scaron M, Eme L, Roger AJ, Rokas A, Shen X, Strassert JFH, Kol & iacutesko M, Brown MW. Bajo revisión. PhyloFisher: un paquete filogenómico para resolver las relaciones eucariotas.

2021
62. Kang S + *, Tice AK + *, Escaleras CW, Lahr DJG, Jones RE +, Brown MW. 2021. El complejo adhesivo mediado por integrinas en el antepasado de animales, hongos y amebas. Biología actual . https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.04.076 @ Preprint bioRivx 10.1101 / 2020.04.29.069435. * = Contribuido igualmente (primero). @

61. Porf & iacuterio-Sousa A, Tice AK +, Brown MW, Lahr DJG. 2021. Reconstrucción filogenética y evolución de la familia de genes Rab GTPasa en amebozoos. Pequeñas GTPasas. 10.1080/21541248.2021.1903794 @

2020
60. Salomaki E, Eme L, Brown MW, Kolisko M. 2020. La publicación de conjuntos de datos sin curar es esencial para la filogenómica reproducible. Ecología y Evolución de la Naturaleza. https://doi.org/10.1038/s41559-020-01296-w. * solo revisión editorial, no revisada por pares. PS

59. Lawal HM, Schilde C, Kin K, Brown MW, James J, Prescott AR, Schaap P. 2020. La adaptación al clima frío es una causa plausible de la evolución de la esporulación multicelular en Dictyostelia. Informes científicos. 10: 8797 @

58. Brown MW, Tice AK. 2020. Una caja de herramientas genéticas para protistas marinos. Métodos de la naturaleza . 17: 469 y ndash470. doi: https://doi.org/10.1038/s41592-020-0794-z * solo revisión editorial, no revisada por pares. PS

57. Burki F, Roger AJ, Brown MW, Simpson AGB. 2020. El nuevo árbol de eucariotas. Tendencias en Ecología y Evolución (TREE). 35: 43-55. doi: https://doi.org/10.1016/j.tree.2019.08.008 @

56. Yubuki N, Lopez-Garcia P, Reboul G, Brown MW, Pollet N, Moreira D. 2020. Transferencias genéticas laterales adaptativas antiguas en el simbiótico Opalina - Blastocystis Linaje de Stramenopile. Biología Molecular y Evolución. 37: 651 y ndash659. doi: https://doi.org/10.1093/molbev/msz250 @

55. Onsbring H *, Tice AK + *, Barton BT, Brown MW & rdquo, Ettema TJG & rdquo. 2020. Un flujo de trabajo de transcriptómica unicelular eficiente para eucariotas microbianos comparado en Giardia intestinalis células. BMC Genomics. 21: 448. @ Preprint bioRxiv 10.1101 / 782235v1. DOI: http://dx.doi.org/10.1101/782235. * && rdquo = Contribuyó igualmente (primero y último). @

2019
54. Marrón MW. 2019. Tinción fluorescente eficaz y eficiente del citoesqueleto (actina y microtúbulos) de células eucariotas adherentes. Protocolos.io . doi: http://dx.doi.org/10.17504/protocols.io.8wkhxcw no revisado por pares



53. Lahr DJG, Kosakyana A, Lara E, Mitchell EAD, Morais L, Porfirio-Sousa AL, Ribeiro GM, Tice AK +, P & aacutenek T *, Kang S +, Brown MW. 2019. La filogenómica y la reconstrucción morfológica ancestral de amebas testadas demuestran una alta diversidad de eucariotas microbianos en el Neoproterozoico. Biología actual. 29 (6): 911-1003.e3. @


52. Fiore-Donno AM, Tice AK +, Brown MW. 2019. Un miembro no flagelado de la Myxogastria y expansión de la Echinosteliida. Revista de microbiología eucariota. 66: 538-544. doi: https://doi.org/10.1111/jeu.12694 @

51. Schuler GA +, Brown MW. 2019. Descripción de Armaparvus languidus norte. gen. norte. sp. confirma la unidad ultraestructural de Cutosea (Amoebozoa, Evosea). Revista de microbiología eucariota. 66: 158-166. doi: https://dx.doi.org/10.1111/jeu.12640 @

50. Adl SM, Bass D, Lane CE, Luke & scaron J, Schoch CL Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, C & aacuterdenas P, Čepička I, Chistyakova L, del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA Hoppenrath M, James TY, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD , Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Simpson AGB, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q.2019. Revisiones de la clasificación, nomenclatura y diversidad de eucariotas. Revista de microbiología eucariota. 66: 4-119. doi: https://doi.org/10.1111/jeu.12691. @

2018
49. Hofstatter PG, Brown MW, Lahr DJG. 2018. La genómica comparada apoya el sexo y la meiosis en diversos amebozoos. Biología y evolución del genoma. 10: 3118 y ndash3128. doi: https://doi.org/10.1093/gbe/evy241 @

48. del Campo J, Kolisko M, Boscaro V, Santoferrara L, Massana R, Guillou L, Simpson AGB, Berney C, de Vargas C, Kaye J, Bender S, Brown MW, Keeling P, Wegener Parfrey L. 2018. EukRef : curación filogenética de ARN ribosómico para mejorar la comprensión de la diversidad y distribución eucariotas. PLoS Biology. doi: https://doi.org/10.1371/journal.pbio.2005849. Preimpresión bioRxiv 278085 doi: https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/07/278085 @

47. Schuler GA +, Tice AK +, Pearce RA, Foreman E ^, Stone J, Gammill S, Willson JD, Reading C, Silberman JD, Brown MW. 2018. La filogenia y clasificación de la diversidad novedosa en Sainouroidea (Cercozoa, Rhizaria) arroja luz sobre un clado muy diverso y divergente. Protista. 169: 853 y ndash874. @

46. ​​Heiss AA, Kolisko M, Ekelund F, Brown MW, Roger AJ, Simpson AGB. 2018. Reexamen morfológico y filogenómico combinado de malawimonadas, un taxón crítico para inferir la historia evolutiva de eucariotas. Ciencia Abierta de la Royal Society. 5: 171707. @

45. Brown MW, Heiss AA, Kamikawa R, Inagaki Y, Yabuki A, Tice AK +, Shiratori T, Ishida K, Hashimoto T, Simpson AGB, Roger AJ. 2018. La filogenómica coloca a los linajes de protistan huérfanos en un nuevo supergrupo eucariota. Biología y evolución del genoma. 10: 427-433 . Preimpresión bioRxiv 227884 doi: https://doi.org/10.1101/227884. ARCHIVO SUPLEMENTARIO - Árboles y alineaciones de un solo gen (Brown_etal.2017.CRuMS.tgz) @

44. Leonard G, Labarre A, Milner D, Monier A, Soanes D, Wideman JG, Maguire F, Stevens S, Sain D, Grau-Bove X, Sebe-Pedros A, Stajich JE, Paszkiewicz K, Brown MW, Hall N , Wickstead B, Richards TA. 2018. Análisis genómico comparativo del & lsquopsuedofungus & rsquo Catenoides de Hyphochytrium. Biología abierta. 8: 170184 . @

2017
43. Kang S +, Tice AK +, Spiegel FW, Silberman JD, P & aacutenek T, Čepička I, Kostka M, Kosakyan A, Alc & acircntara DM, Roger AJ, Shadwick LL, Smirnov A, Kudryavstev A, Lahr DJG, Brown MW. 2017. Entre una vaina y una prueba dura: la profunda evolución de las amebas. Biología Molecular y Evolución. 34: 2258-2270. ARCHIVO SUPLEMENTARIO - Árboles y alineaciones de un solo gen (Kang_etal.2017.tgz) @

42. Geisen S, Mitchell EAD, Wilkinson DM, Adl S, Bonkowski M, Brown MW, Fiore-Donno AM, Heger TJ, Jassey VEJ, Krashevska V, Lahr DJG, Marcisz K, Mulot M, Payne R, Singer D, Anderson O, Charman DJ, Ekelund F, Griffiths BS, R & oslashnn R, Smirnov A, Bass D, Belbahri L, Berney C, Blandenier Q, Chatzinotas A, Clarholm M, Dunthorn M, Feest A, Fernandez-Parra LD, Foissner W, Fournier B, Gentekaki E, Hajek M, Helder J, Jousset A, Koller R, Kumar S, La Terza A, Lamentowicz M, Mazei Y, Santos SS, Seppey CVW, Spiegel FW, Walochnik J, Winding A, Lara E. 2017. Reinicio de la protistología del suelo: 30 preguntas fundamentales para empezar. Biología y bioquímica del suelo . 111: 94-103. @

41. Spiegel FW, Shadwick LL, Ndiritu G, Brown MW, Aguilar M, Shadwick JD. 2017. Amoebozoos protosteloides (Protosteliida, Protosporangiida, Cavosteliida, Schizoplasmodiida, Fractoviteliida y miembros esporocarpicos de Vannellida, Centramoebida y Pellitida). En Archibald, Simpson, Slamovits, Margulis, Melkonian, Chapman, Corliss (Eds.) Manual de los protistas . Springer International Publishing. págs. 1-38. ISBN: 978-3-319-32669-6. DOI: 10.1007 / 978-3-319-32669-6_12-1. @

2016
40. P & aacutenek T, Simpson AGB, Brown MW, Dexter-Dyer B. 2016. Heterolobosea. En Archibald, Simpson, Slamovits, Margulis, Melkonian, Chapman, Corliss (Eds.) Manual de los protistas . Springer International Publishing. págs. 1-42. ISBN: 978-3-319-32669-6. DOI: 10.1007 / 978-3-319-32669-6_10-1. @

39. Tice AK +, Shadwick LL, Fiore-Donno AM, Geisen S, Kang S +, Schuler GA +, Spiegel FW, Wilkinson K, Bonkowski M, Dumack K, Lahr DJG, Voelcker E, Clau & szlig S, Zhang J, Brown MW. 2016. Expansión de la diversidad molecular y morfológica de Acanthamoebidae (Centramoebida, Amoebozoa) e identificación de un nuevo tipo de ciclo de vida dentro del grupo. Biology Direct. 11: 69. @

38. Heiss AA, Brown MW, Simpson AGB. 2016. Apusomonadida. En Archibald, Simpson, Slamovits, Margulis, Melkonian, Chapman, Corliss (Eds.) Manual de los protistas . Springer International Publishing. págs. 1-27. ISBN: 978-3-319-32669-6. DOI: 10.1007 / 978-3-319-32669-6_15-1. @

37. Hofstatter P, Tice AK +, Kang S +, Brown MW *, Lahr DJG *. 2016. Evolución de la recombinasa A bacteriana ( recA ) en eucariotas explicado por la adición de datos genómicos de linajes microbianos clave. Actas de la Royal Society B: Ciencias biológicas 283: 20161453. * Ambos últimos autores corresponden. @

36. Gawryluk RMR, Kamikawa R, Stairs CW, Silberman JD, Brown MW, Roger AJ. 2016. Las primeras etapas de la adaptación mitocondrial al bajo nivel de oxígeno reveladas en un nuevo rizariano. Biología actual 26 (20): 2729 y ndash2738. @

35. Tice AK +, Brown MW, Altig R. 2016. Hyla chrysoscelis (Cope & rsquos gray treefrog), H. avivoca (rana arborícola con voz de pájaro), y H. cinerea (rana arborícola verde). Interacciones de protozoos y algas con huevos de rana y renacuajos. Revisión herpetológica 47(3): 438-439. $

34. Shadwick LL, Brown MW, Tice AK +, Spiegel FW. 2016. Una nueva ameba con fructificación protosteloide: Luapeleamoeba hula norte. gramo. norte. sp. Acta Protozoologica 55(3): 123-134. @

33. Harding T, Brown MW, Simpson AGB, Roger AJ. 2016. Estrategia osmoadaptativa y su firma molecular en protistas heterótrofos obligadamente halófilos. Biología y evolución del genoma 8(7): 2241-2258 . @

32. Hamann E, Gruber-Vodicka H, ​​Kleiner M, Tegetmeyer HE, Riedel D, Littmann S, Chen J, Milucka J, Viehweger B, Becker KW, Dong X, Stairs CW, Hinrichs K, Brown MW, Roger AJ, Strous M. 2016. Mutualista del puerto de Breviatea medioambiental Arcobacter epibiontes. Naturaleza 534: 254-258. @

31. Noguchi F, Tanifuji G, Brown MW, Fujikura K, Takishita K. 2016. Evolución compleja de dos tipos de cardiolipina sintasa en el linaje eucariota Stramenopiles. Filogenética molecular y evolución 101: 133-141. @

30. Walthall AC ^, Tice AK +, Brown MW. 2016. Una nueva especie de Flamella (Amoebozoa, Variosea, Gracilipodida) aislado de una piscina de agua dulce en el sur de Mississippi, EE. UU. Acta Protozoologica 55(2): 111-117 . @

29. Tice AK +, Silberman JD, Walthall AC ^, Le KND, Spiegel FW, Brown MW. 2016. Sorodiplophrys stercorea : otro nuevo linaje de multicelularidad sorocarpic. Revista de microbiología eucariota 63(5): 623-628. @

28. Bass D, Silberman JD, Brown MW, Pearce RA, Tice AK +, Jousset A, Geisen S, Hartikainen H. 2016. Amebas coprofílicas y flagelados, incluidos Guttulinopsis, Rosculus y Helkesimastix , caracterizan una radiación rizariana divergente y diversa y contribuyen a una gran diversidad de protistas asociados a las heces. Microbiología ambiental 18(5): 1604-1619. @

27. P & aacutenek T, Zadrob & iacutelkov & aacute E, Walker G, Brown MW, Gentekaki E, Hroudov & aacute M, Kang S +, Roger AJ, Tice AK +, Vlček C, Čepička I. 2016. Primer análisis multigénico de Archamoebae (Amoebozoa: its Conosa) filogenia y muestra que Entamoebidae representa un linaje profundo del grupo. Filogenética molecular y evolución 98: 41 y ndash51. @

26. Brown LR, Gunnell SM, Cassella A, Keller LE, Scherkenbach LA, Mann B, Brown MW, Rosch JW, Tuomanen EI, Thornton JA. 2016. AdcAII de steotococos neumonia afecta la invasividad neumocócica. Más uno 11 (1): e0146785 . @

2015
25. Sharpe SC, Eme L, Brown MW, Roger AJ. 2015. Cronometraje de los orígenes de eucariotas multicelulares a través de filogenómica y análisis de reloj molecular relajado *. En Nedelcu, Ruiz-Trillo (Eds.) Transiciones evolutivas a la vida multicelular: Principios y mecanismos. Springer, Nueva York. págs. 3-29. ISBN 978-94-017-9641-5. DOI: 10.1007 / 978-94-017-9642-2_1 . * revisado por pares. @

2014
24. Maguire F, Henriquez FL, Leonard G, Dacks JB, Brown MW, Richards TA. 2014. Patrones complejos de fisión genética en la vía de biosíntesis de folato eucariota. Biología y evolución del genoma 6 (10): 2709 y ndash2720 . @

23. Watson PM ^, Sorrell SC ^, Brown MW. 2014. Ptolemeba norte. gen., un género novedoso de amebas hartmannellid (Tubulinea, Amoebozoa) con énfasis en la taxonomía de Saccamoeba . Revista de microbiología eucariota 61 (6): 611 y ndash619 . @

22. Eme L, Sharpe SC, Brown MW, Roger AJ. 2014. Sobre la era de los eucariotas: evaluación de la evidencia de fósiles y relojes moleculares. Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología 6: a016139 . Parte de Perspectivas de Cold Spring Harbor sobre El origen y la evolución de los eucariotas . Keeling, Koonin (Eds.). @

21. Escaleras CW, Eme L, Brown MW, Mutsaers C, Susko E, Dellaire G, Soanes DM, van der Giezen M, Roger AJ. 2014. Un sistema de biogénesis de racimo SUF Fe-S en los orgánulos relacionados con las mitocondrias del protista microaerófilo. Pygsuia . Biología actual 24: 1176 y ndash1186 .

20. Tanifuji G, Onodera N, Brown MW, Curtis BA, Roger AJ, Wong GK, Melkonian M, Archibald JM. 2014. Secuencias del genoma de nucleomorfos y plastidios de la cloraracniófita. Lotharella oceanica : evolución reductora convergente y recombinación frecuente en algas portadoras de nucleomorfos. BMC Genomics 15: 374 . @

19. Kudryavtsev A, Brown MW, Tice A, Spiegel FW, Pawlowski J, Anderson OR. 2014. Una revisión del orden Pellitida Smirnov et al., 2011 (Amoebozoa, Discosea) basada en evidencia ultraestructural y molecular, con descripción de Endostelium crystalliferum norte. sp. Protista 165(2): 208-229 . @

18. Suga H, Torruella G, Burger G, Brown MW, Ruiz-Trillo I. 2014. Expansión holozoica más temprana de la señalización de fosfotirosina. Biología molecular y evolución 31(3): 517-528 . @

17. Kamikawa R, Kolisko M, Nishimura Y, Yabuki A, Brown MW, Ishikawa SA, Ishida K, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y.2014. Evolución del contenido genético en mitocondrias discobidas deducidas de la posición filogenética y el genoma mitocondrial completo de Tsukubamonas globosa . Biología y evolución del genoma 6 (2): 306 y ndash315 . @

2013
16. Brown MW, Sharpe SC, Silberman JD, Heiss A, Lang BF, Simpson AGB, Roger AJ. 2013. La filogenómica demuestra que los flagelados de breviario están relacionados con los opistocontos. Actas de la Royal Society B: Ciencias biológicas 280: 20131755 . ARCHIVO SUPLEMENTARIO - Árboles y alineaciones de un solo gen (Brown_etal.2013.SingleGenes.tgz) @

15. Brown MW +, Silberman JD. 2013. Las amebas sorocarpicas no dictyostelid *. En Romeralo, Escalante, Baldauf (Eds.) Dictyostelids - Evolución, Genómica y Biología Celular. Springer, Heidelberg Alemania. págs. 219-242. ISBN 978-3-642-38487-5. DOI: 10.1007 / 978-3-642-38487-5_12 . + Autor sénior y para correspondencia. * solo revisión editorial, no revisada por pares. PS

14. Suga H, Chen Z, de Mendoza A, Seb & eacute-Pedr & oacutes A, Brown MW, Kramer E, Carr M, Kerner P, Vervoort M, S & aacutenchez-Pons N, Torruella G, Derelle R, Manning G, Lang BF, Russ C, Haas BJ, Roger AJ, Nusbaum C, Ruiz-Trillo I. 2013. El Capsaspora El genoma revela una prehistoria unicelular compleja de animales. Comunicaciones de la naturaleza 4: 2325 . @


13. Kamikawa R, Brown MW, Nishimura Y, Sako Y, Heiss AA, Yubuki N, Gawryluk R, Simpson AGB, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y.2013. Remodelado paralelo de EF-1 y función alfa: divergente EF- Los genes 1 & alfa coexisten con los genes EFL en diversos eucariotas relacionados lejanamente. Biología Evolutiva BMC 13: 131 . @

12. Harding T, Brown MW, Plotnikov A, Selivanova E, Park JS, Gunderson JH, Baumgartner M, Silberman JD, Roger AJ, Simpson AGB. 2013. Etapas de ameba en los heteroloboseanos de ramificación más profunda, incluidos Pharyngomonas : implicaciones evolutivas y sistemáticas. Protista 164(2): 272-286 . @

2012
11. Adl SM, Simpson AGB, Lane CE, Lukes J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Legall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EAD, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick LL, Schoch C, Smirnov A, Spiegel FW. 2012. La clasificación revisada de eucariotas. Revista de microbiología eucariota 59 (5): 429 y ndash514 . @

10. Brown MW, Kolisko M, Silberman JD, Roger AJ. 2012. La multicelularidad agregada evolucionó de forma independiente en el supergrupo eucariota Rhizaria. Biología actual 22(12): 1123-1127 . Pelicula 1 , Película 2 . @

9. Brown MW, Silberman JD, Spiegel FW. 2012. Una evaluación contemporánea de los acrasidos (Acrasidae, Heterolobosea, Excavata). Revista europea de protistología 48(2): 103-123 . @

8. Schnittler M, Novozhilov YK, Romeralo M, Brown MW, Spiegel FW. 2012. Protistas formadores de cuerpos frutales: Myxomycetes y organismos similares a Myxomycetes Acrasia, Eumycetozoa *. En Frey (Ed.) Engler & rsquos Syllabus of Plant Families, 13ª ed. Parte 1: Algas verdiazules, mixomicetos y organismos similares a los mixomicetos, protistas fitoparásitos, heterokontobionta heterótrofos y hongos . Editores de ciencia Borntraeger, Berlín. ISBN 978-3-443-01061-4. DOI: 10.13140 / 2.1.4668.9284 . * solo revisión editorial, no revisada por pares. PS

2011
7. Brown MW, Silberman JD, Spiegel FW. 2011. & ldquoSlime mohos & rdquo entre los Tubulinea (Amoebozoa): Sistemática molecular y taxonomía de Copromyxa . Protista 162: 277-287 . @

2010
6. Brown MW, Silberman JD, Spiegel FW. 2010. Una especie morfológicamente simple de Acrasis (Heterolobosea, Excavata), Acrasis helenhemmesae norte. sp. Revista de microbiología eucariota 57(4): 346-353 . @

5. Marrón MW. 2010. Ph.D. Disertación, Universidad de Arkansas, Ciencias Biológicas. Colocación de los moldes de limo olvidados ( Sappinia , Copromyxa , Fonticula , Acrasis , y Pocheina ), utilizando filogenia molecular . 258p. (Silberman JD & Spiegel FW, Co-Supervisores).

2009
4. Brown MW, Spiegel FW, Silberman JD. 2009. Filogenia del moho de limo celular & ldquofordado & rdquo, Fonticula alba , revela una rama evolutiva clave dentro de Opisthokonta. Biología molecular y evolución 26(12): 2699-2709 . @

3. Shadwick LL, Spiegel FW, Shadwick JDL, Brown MW, Silberman JD. 2009. Eumycetozoa = Amoebozoa ?: SSUrDNA Phylogeny of Protosteloid Slime Molds y su importancia para el supergrupo Amoebozoa. Más uno 4 (8): e6754 . @

2007
2. Spiegel FW, Shadwick JD, Lindley LA, Brown MW, Nderitu G. 2007. Una guía para principiantes y rsquos para identificar los protostelids. http://slimemold.uark.edu/pdfs/Handbook1_3rd.pdf no revisado por pares.



1. Brown MW, Spiegel FW, Silberman JD. 2007. Ameba en atención: afinidad filogenética de Sappinia pedata . Revista de microbiología eucariota 54(6): 511-519 . @

Resúmenes publicados
Hofstatter PG, Lahr DJG, Brown MW. 2016. Transferencia génica endosimbiótica primaria y secundaria de RecA bacteriana en eucariotas. Protistología 10(2):27

Kosakyan A, Brown MW, Lara E, Mitchell EAD, Lahr DJG. 2016. Reduciendo la brecha entre la taxonomía tradicional y la transcriptómica en arcelínidos (Amoebozoa). Protistología 10(2):37

Tice AK, Shadwick LL, Spiegel FW, Geisen S, Fiore-Donno AM, Bonkowski M, Dumack K, Kang S, Brown MW. 2016. Muchos amebozoos sedis previamente incertae encuentran un hogar dentro de Centramoebida. Protistología 10(2):80.

Park JS, Grimm K, Zhang QQ, Harding T, Brown MW, Simpson AGB. 2011. La filogenia y la evolución de nivel más profundo de Heterolobosea: un grupo importante de protistas. Reunión conjunta de la Phycological Society of America y la International Society of Protistologists. Universidad de Washington. Seattle, Washington, Estados Unidos. Revista de Phycology 47: S32.

Brown MW, Silberman JD, Spiegel FW. 2008. Variación morfológica y molecular en tres morfotipos de Acrasis . Reunión anual de la Mycological Society of America. Universidad Penn State, Pensilvania, Estados Unidos. Inóculo 59(4): 21 .

Brown MW, Spiegel FW 2007. Evaluación de la diversidad de protoesteélidos en los bosques de roble y nogal de la meseta de Ozark en el centro sur de EE. UU. Reunión anual de la Mycological Society of America. Universidad Estatal de Luisiana. Baton Rogue, Luisiana, Estados Unidos. Inóculo 59(2): 9.

Lindley LA, Brown MW, Lawrence A, Silberman JD, Spiegel FW. 2007. Esquizoplasmodium : género reconstituido. Reunión anual de la Mycological Society of America. Universidad Estatal de Luisiana, Luisiana, Estados Unidos. Inóculo 59(2): 27.

Spiegel FW, Shadwick JD, Brown MW, Hemmes DE. 2007. Protostelids of the Hawaiian Archipiélago. Reunión anual de la Mycological Society of America. Universidad Estatal de Luisiana, Luisiana, Estados Unidos. Inóculo 59(2): 38.


Distribución a gran escala de especies de atún en un océano que se calienta

Maite Erauskin-Extramiana, AZTI, División de Investigación Marina, Sukarrieta, País Vasco, España.

AZTI, División de Investigación Marina, Pasaia, País Vasco, España

Océanos y atmósfera, Organización de Investigaciones Científicas e Industriales de la Commonwealth, Hobart, Tas., Australia

Instituto de Ciencias del Mar, Passeig Marítim, Barcelona, ​​Cataluña, España

AZTI, División de Investigación Marina, Sukarrieta, País Vasco, España

AZTI, División de Investigación Marina, Pasaia, País Vasco, España

AZTI, División de Investigación Marina, Pasaia, País Vasco, España

AZTI, División de Investigación Marina, Sukarrieta, País Vasco, España

AZTI, División de Investigación Marina, Sukarrieta, País Vasco, España

Maite Erauskin-Extramiana, AZTI, División de Investigación Marina, Sukarrieta, País Vasco, España.

AZTI, División de Investigación Marina, Pasaia, País Vasco, España

Océanos y atmósfera, Organización de Investigaciones Científicas e Industriales de la Commonwealth, Hobart, Tas., Australia

Instituto de Ciencias del Mar, Passeig Marítim, Barcelona, ​​Cataluña, España

AZTI, División de Investigación Marina, Sukarrieta, País Vasco, España

AZTI, División de Investigación Marina, Pasaia, País Vasco, España

AZTI, División de Investigación Marina, Pasaia, País Vasco, España

AZTI, División de Investigación Marina, Sukarrieta, País Vasco, España

Abstracto

El atún es una especie distribuida mundialmente de gran importancia comercial y algunas especies de atún son una fuente importante de proteínas en muchos países. Los atunes se caracterizan por patrones de distribución dinámica que responden a la variabilidad climática y al cambio a largo plazo. Aquí, investigamos el efecto de las condiciones ambientales en la distribución mundial y la abundancia relativa de seis especies de atún entre 1958 y 2004 y estimamos los cambios esperados para finales de siglo basados ​​en un escenario de alta concentración de gases de efecto invernadero (RCP8.5). . Creamos modelos de distribución de especies utilizando un conjunto de datos de pesquerías de palangre japonés a largo plazo y modelos aditivos generalizados de dos pasos. Durante el período histórico, los hábitats adecuados se desplazaron hacia los polos para 20 de las 22 poblaciones de túnidos, según su centro de gravedad (CG) y / o uno de sus límites de distribución. En promedio, los límites de distribución del hábitat del atún se han desplazado hacia los polos 6,5 km por década en el hemisferio norte y 5,5 km por década en el hemisferio sur. Se esperan cambios más importantes en la distribución del atún y cambios en la abundancia en el futuro, especialmente a finales de siglo (2080-2099). Se espera que los túnidos templados (albacora, atún rojo del Atlántico y atún del sur) y el patudo tropical disminuyan en los trópicos y se desplacen hacia los polos. Por el contrario, se prevé que los atunes barrilete y aleta amarilla sean más abundantes en las zonas tropicales, así como en la mayoría de las zonas económicas exclusivas (ZEE) de los países costeros. Estos resultados proporcionan información global sobre los efectos potenciales del cambio climático en las poblaciones de atún y pueden ayudar a los países que buscan minimizar estos efectos a través de una gestión adaptativa.

Tenga en cuenta: El editor no es responsable del contenido o la funcionalidad de la información de apoyo proporcionada por los autores. Cualquier consulta (que no sea el contenido faltante) debe dirigirse al autor correspondiente del artículo.


Introducción

Se informa ampliamente que el cambio climático está teniendo un impacto profundo en el funcionamiento de los ecosistemas (Hoegh-Guldberg y Bruno, 2010). La abundancia y distribución de especies está cambiando debido al entorno cambiante (Jones y Cheung, 2015, Poloczanska et al., 2013). La fenología reproductiva de las especies migratorias también está cambiando en respuesta al cambio ambiental (por ejemplo, McCarty, 2001, Parmesan et al., 1999, Walther, 2010). Además, la pérdida de hábitat inducida por el cambio climático pone a las especies en riesgo de extinción cuando no se dispone de un hábitat alternativo adecuado (Foden et al., 2013). El riesgo de cambio climático es particularmente pronunciado para los ectotermos marinos, ya que se ajustan más a los límites de tolerancia térmica que los ecotermos terrestres (Sunday et al., 2012) y, en particular, las especies cuya biología y fenología están íntimamente ligadas a la temperatura (Somero, 2010). ). De particular preocupación son las especies que exhiben una determinación del sexo dependiente de la temperatura. Esto se aplica a la mayoría de los reptiles, incluidas las tortugas marinas. La preocupación por el cambio climático es de particular importancia para las tortugas marinas considerando que seis de las siete especies están clasificadas como en peligro crítico, en peligro o vulnerables por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN, 2014).

Uno de los desafíos de conservación para los ecologistas de las tortugas marinas es que el cambio climático está afectando a las tortugas marinas en más de una forma. Por ejemplo, el aumento del nivel del mar puede provocar la pérdida de las playas en las que las hembras dependen para anidar (Fish et al., 2008, Fuentes et al., 2009a). Los modelos de cambio climático también predicen un aumento de lluvias y tormentas en ciertos sitios, lo que puede ser perjudicial para los nidos, ya que la exposición a altos niveles de agua impacta negativamente en el éxito de un nido (Patino-Martinez et al., 2014). El aumento de la temperatura del aire también es una preocupación para las especies que exhiben una determinación del sexo dependiente de la temperatura y puede conducir a proporciones de sexos sesgadas y extinciones locales (Janzen, 1994). As such, increasing temperature was recently identified as one of the biggest threats to sea turtle populations' viabilities (Fuentes and Cinner, 2010).


Electronic supplementary material is available online at https://doi.org/10.6084/m9.figshare.c.5025788.

Publicado por la Royal Society. Reservados todos los derechos.

Referencias

Barnes DKA, Galgani F, Thompson RC, Barlaz M

. 2009 Accumulation and fragmentation of plastic debris in global environments . Phil. Trans. R. Soc. B 364, 1985-1998. (doi:10.1098/rstb.2008.0205) Link, ISI, Google Scholar

. 2019 Future scenarios of global plastic waste generation and disposal . Palgrave Commun. 5, 1-11. (doi:10.1057/s41599-018-0212-7) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2014 Plastic debris in the open ocean . Proc. Natl Acad. Sci. Estados Unidos 111, 10 239-10 244. (doi:10.1073/pnas.1314705111) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2011 Microplastics in the marine environment . Mar. Pollut. Toro. 62, 1596-1605. (doi:10.1016/j.marpolbul.2011.05.030) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Lusher AL, Welden NA, Sobral P, Cole M

. 2017 Sampling, isolating and identifying microplastics ingested by fish and invertebrates . Anal. Methods 9, 1346-1360. (doi:10.1039/c6ay02415g) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2018 Plastics in soil: analytical methods and possible sources . Sci. Entorno total. 612, 422-435. (doi:10.1016/j.scitotenv.2017.08.086) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

de Souza Machado AA, Kloas W, Zarfl C, Hempel S, Rillig MC

. 2018 Microplastics as an emerging threat to terrestrial ecosystems . Glob. Chang. Biol. 24, 1405-1416. (doi:10.1111/gcb.14020) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Rillig MC, de Souza Machado AA, Lehmann A, Klümper U

. 2019 Evolutionary implications of microplastics for soil biota . Reinar. Chem. 16, 3-7. (doi:10.1071/EN18118) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Selonen S, Dolar A, Jemec Kokalj A, Skalar T, Parramon Dolcet L, Hurley R, van Gestel CAM

. 2020 Exploring the impacts of plastics in soil – The effects of polyester textile fibers on soil invertebrates . Sci. Entorno total. 700, 134451. (doi:10.1016/j.scitotenv.2019.134451) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2020 Microplastics: an emerging threat to food security and human health . J. Food Sci. Technol. 57, 1601-1608. (doi:10.1007/s13197-019-04138-1) Crossref, PubMed, Google Scholar

Helmberger MS, Tiemann LK, Grieshop MJ

. 2020 Towards an ecology of soil microplastics . Funct. Ecol. 34, 550-560. (doi:10.1111/1365-2435.13495) Crossref, ISI, Google Scholar

do Sul JAI, Barnes DKA, Costa MF, Convey P, Costa ES, Campos L

. 2011 Plastics in the Antarctic environment: are we looking only at the tip of the iceberg ? Oecologia Aust. 15, 150-170. (doi:10.4257/oeco.2011.1501.11) Crossref, Google Scholar

. 2019 Are we speaking the same language? Recommendations for a definition and categorization framework for plastic debris . Reinar. Sci. Technol. 53, 1039-1047. (doi:10.1021/acs.est.8b05297) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Munari C, Infantini V, Scoponi M, Rastelli E, Corinaldesi C, Mistri M

. 2017 Microplastics in the sediments of Terra Nova Bay (Ross Sea, Antarctica) . Mar. Pollut. Toro. 122, 161-165. (doi:10.1016/j.marpolbul.2017.06.039) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Reed S, Clark M, Thompson R, Hughes KA

. 2018 Microplastics in marine sediments near Rothera Research Station, Antarctica . Mar. Pollut. Toro. 133, 460-463. (doi:10.1016/j.marpolbul.2018.05.068) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Lacerda ALdF, Rodrigues LdosS, van Sebille E, Rodrigues FL, Ribeiro L, Secchi ER, Kessler F, Proietti MC

. 2019 Plastics in sea surface waters around the Antarctic Peninsula . Sci. Reps. 9, 3977. (doi:10.1038/s41598-019-40311-4) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2013 Entanglement of Antarctic fur seals at Bird Island, South Georgia . Mar. Pollut. Toro. 74, 244-252. (doi:10.1016/j.marpolbul.2013.06.050) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 1988 Plastic ingestion by petrels breeding in Antarctica . Mar. Pollut. Toro. 19, 672-674. (doi:10.1016/0025-326X(88)90388-8) Crossref, ISI, Google Scholar

Auman HJ, Woehler EJ, Riddle MJ, Burton H

. 2004 First evidence of ingestion of plastic debris by seabirds at sub-Antarctic Heard Island . Mar. Ornithol. 32, 105-106. Google Académico

Bessa F, Ratcliffe N, Otero V, Sobral P, Marques JC, Waluda CM, Trathan PN, Xavier JC

. 2019 Microplastics in gentoo penguins from the Antarctic region . Sci. Reps. 9, 1-7. (doi:10.1038/s41598-019-50621-2) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Laganà P, Caruso G, Corsi I, Bergami E, Venuti V, Majolino D, La Ferla R, Azzaro M, Cappello S

. 2019 Do plastics serve as a possible vector for the spread of antibiotic resistance? First insights from bacteria associated to a polystyrene piece from King George Island (Antarctica) . En t. J. Hyg. Reinar. Salud 222, 89-100. (doi:10.1016/j.ijheh.2018.08.009) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Lee JR, Raymond B, Bracegirdle TJ, Chadès I, Fuller RA, Shaw JD, Terauds A

. 2017 Climate change drives expansion of Antarctic ice-free habitat . Naturaleza 547, 49-54. (doi:10.1038/nature22996) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2007 Antarctic biodiversity . Ciencias 317, 1877-1878. (doi:10.1126/science.1147261) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2017 Antarctic ecosystems . En Reference module in life sciences , pp. 1-13. Amsterdam, The Netherlands : Elsevier . (doi:10.1016/B978-0-12-809633-8.02182-8) Google Scholar

Convey P, Gibson JAE, Hillenbrand CD, Hodgson DA, Pugh PJA, Smellie JL, Stevens MI

. 2008 Antarctic terrestrial life - Challenging the history of the frozen continent? Biol. Rvdo. 83, 103-117. (doi:10.1111/j.1469-185X.2008.00034.x) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2019 Nematodes in a polar desert reveal the relative role of biotic interactions in the coexistence of soil animals . Comun. Biol. 2, 63. (doi:10.1038/s42003-018-0260-y) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2019 Biotic interactions are an unexpected yet critical control on the complexity of an abiotically driven polar ecosystem . Comun. Biol. 2, 62. (doi:10.1038/s42003-018-0274-5) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2000 Historical biogeography and ecology of a Continental Antarctic mite genus, Maudheimia (Acari, Oribatida): evidence for a Gondwanan origin and Pliocene-Pleistocene speciation . Zool. J. Linn. Soc. 129, 111-128. (doi:10.1006/zjls.1999.0209) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2005 A 7000-year record of oribatid mite communities on a Maritime-Antarctic island: responses to climate change . Arctic, Antarct. Alp. Res. 37, 239-245. (doi:10.1657/1523-0430(2005)037[0239:AYROOM]2.0.CO2) Crossref, ISI, Google Scholar

. 1995 Collembola from the Scotia Arc and Antarctic Peninsula including descriptions of two new species and notes on biogeography . Pol. Pismo Entomol. (Bulletin Entomol. Pologne) 64, 305-319. Google Académico

. 1967 Collembola (Springtails) . Antarct. Res. Ser. 10, 123-148. (doi:10.1029/AR010p0123) Google Scholar

. 1971 The Collembola of Antarctica . Pacific Insects Monogr. 25, 57-74. Google Académico

. 2014 Using Fourier transform IR spectroscopy to analyze biological materials . Nat. Protocolos. 9, 1771-1791. (doi:10.1007/s13398-014-0173-7.2) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Maaß S, Daphi D, Lehmann A, Rillig MC

. 2017 Transport of microplastics by two collembolan species . Reinar. Pollut. 225, 456-459. (doi:10.1016/j.envpol.2017.03.009) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Zhu D, Chen QL, An XL, Yang XR, Christie P, Ke X, Wu LH, Zhu YG

. 2018 Exposure of soil collembolans to microplastics perturbs their gut microbiota and alters their isotopic composition . Soil Biol. Biochem. 116, 302-310. (doi:10.1016/j.soilbio.2017.10.027) Crossref, ISI, Google Scholar

. 1982 The Signy Island terrestrial reference sites: XIV. Population studies on the Collembola . Br. Antarct. Surv. Toro. 55, 33-49. Google Académico

Bokhorst S, Ronfort C, Huiskes A, Convey P, Aerts R

. 2007 Food choice of Antarctic soil arthropods clarified by stable isotope signatures . Polar Biol. 30, 983-990. (doi:10.1007/s00300-007-0256-4) Crossref, ISI, Google Scholar

. 1970 The biology of Cryptopygus antarcticus . En Antarctic ecology (ed.

), pp. 909-918. London, UK and New York, NY : Academic Press . Google Académico

. 1985 A rthropod interactions in an Antarctic terrestrial community . En Antarctic nutrient cycles and food webs (eds

Siegfried WR, Condy PR, Laws RM

), pp. 614-619. Berlín, Alemania: Springer. Crossref, académico de Google

. 1981 Feeding and growth in the Antarctic collembolan Cryptopygus antarcticus . Oikos 36, 59-64. (doi:10.2307/3544379) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2013 Analysis of water sorption and thermal conductivity of expanded polystyrene insulation materials . Build. Serv. Ing. Res. Technol. 34, 407-416. (doi:10.1177/0143624412462043) Crossref, ISI, Google Scholar

Bergami E, Krupinski Emerenciano A, González-Aravena M, Cárdenas CA, Hernández P, Silva JRMC, Corsi I

. 2019 Polystyrene nanoparticles affect the innate immune system of the Antarctic sea urchin Sterechinus neumayeri . Polar Biol. 42, 743-757. (doi:10.1007/s00300-019-02468-6) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2019 Effects of polyethylene microplastics on the gut microbial community, reproduction and avoidance behaviors of the soil springtail, Folsomia candida . Reinar. Pollut. 247, 890-897. (doi:10.1016/j.envpol.2019.01.097) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Kirstein IV, Kirmizi S, Wichels A, Garin-Fernandez A, Erler R, Löder M, Gerdts G

. 2016 Dangerous hitchhikers? Evidence for potentially pathogenic Vibrio spp. on microplastic particles . Mar. Environ. Res. 120, 1-8. (doi:10.1016/j.marenvres.2016.07.004) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Viršek MK, Lovšin MN, Koren Š, Kržan A, Peterlin M

. 2017 Microplastics as a vector for the transport of the bacterial fish pathogen species Aeromonas salmonicida . Mar. Pollut. Toro. 125, 301-309. (doi:10.1016/j.marpolbul.2017.08.024) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Foulon V, Le Roux F, Lambert C, Huvet A, Soudant P, Paul-Pont I

. 2016 Colonization of polystyrene microparticles by Vibrio crassostreae: light and electron microscopic investigation . Reinar. Sci. Technol. 50, 10 988-10 996. (doi:10.1021/acs.est.6b02720) Crossref, ISI, Google Scholar

Wang J, Liu X, Li Y, Powell T, Wang X, Wang G, Zhang P

. 2019 Microplastics as contaminants in the soil environment: a mini-review . Sci. Entorno total. 691, 848-857. (doi:10.1016/j.scitotenv.2019.07.209) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Jang M, Shim WJ, Han GM, Rani M, Song YK, Hong SH

. 2020 Widespread detection of a brominated flame retardant, hexabromocyclododecane, in expanded polystyrene marine debris and microplastics from South Korea and the Asia–Pacific coastal . Reinar. Pollut. 231, 785-794. (doi:10.1016/j.envpol.2017.08.066) Crossref, Google Scholar

. 2018 The serendipitous value of soil fauna in ecosystem functioning: the unexplained explained . Parte delantera. Reinar. Sci. 6, 149. (doi:10.3389/fenvs.2018.00149) Crossref, ISI, Google Scholar

Maaß S, Hückelheim R, Rillig MC

. 2019 Collembola laterally move biochar particles . Más uno 14, 1-7. (doi:10.1371/journal.pone.0224179) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2000 Scotia Arc Acari: antiquity and origin . Zool. J. Linn. Soc. 130, 309-328. (doi:10.1111/j.1096-3642.2000.tb01633.x) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2016 Trace element contamination and availability in the Fildes Peninsula, King George Island, Antarctica . Reinar. Sci. Process. Impacts 18, 648-657. (doi:10.1039/c6em00052e) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2008 Polybrominated diphenyl ether flame retardants in lichens and mosses from King George Island, maritime Antarctica . Quimiosfera 73, 1589-1593. (doi:10.1016/j.chemosphere.2008.08.035) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Cai M, Yang H, Xie Z, Zhao Z, Wang F, Lu Z, Sturm R, Ebinghaus R

. 2012 Per- and polyfluoroalkyl substances in snow, lake, surface runoff water and coastal seawater in Fildes Peninsula, King George Island, Antarctica . J. Hazard. Mater. 209–210, 335-342. (doi:10.1016/j.jhazmat.2012.01.030) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2015 Occurrence of organochlorine pesticides in the environmental matrices from King George Island, west Antarctica . Reinar. Pollut. 206, 142-149. (doi:10.1016/j.envpol.2015.06.025) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Montone RC, Taniguchi S, Colabuono FI, Martins CC, Cipro CVZ, Barroso HS, da Silva J, Bícego MC, Weber RR


Neurobiology

Corticostriatal flow of action selection bias. Hwang EJ, Link TD, Hu YY, Lu S, Wang EH, Lilascharoen V, Aronson S, O'Neil K, Lim BK, Komiyama T. Neuron. 2019 Nov 6. doi: 10.1016/j.neuron.2019.09.028.

The posterior parietal cortex (PPC) performs many functions, including decision making and movement control. It remains unknown which input and output pathways of PPC support different functions. We addressed this issue in mice, focusing on PPC neurons projecting to the dorsal striatum (PPC-STR) and the posterior secondary motor cortex (PPC-pM2). Projection-specific, retrograde labeling showed that PPC-STR and PPC-pM2 represent largely distinct subpopulations, with PPC-STR receiving stronger inputs from association areas and PPC-pM2 receiving stronger sensorimotor inputs. Two-photon calcium imaging during decision making revealed that the PPC-STR population encodes history-dependent choice bias more strongly than PPC-pM2 or general PPC populations. Furthermore, optogenetic inactivation of PPC-STR neurons or their terminals in STR decreased history-dependent bias, while inactivation of PPC-pM2 neurons altered movement kinematics. Therefore, PPC biases action selection through its STR projection while controlling movements through PPC-pM2 neurons. PPC may support multiple functions through parallel subpopulations, each with distinct input-output connectivity.

Inhibition of Axon Regeneration by Liquid-like TIAR-2 Granules. Andrusiak MG, Sharifnia P, Lyu X, Wang Z, Dickey AM, Wu Z, Chisholm AD, Jin Y. Neuron. 2019 Jul 24. pii: S0896-6273(19)30602-6. doi: 10.1016/j.neuron.2019.07.004.

Phase separation into liquid-like compartments is an emerging property of proteins containing prion-like domains (PrLDs), yet the in vivo roles of phase separation remain poorly understood. TIA proteins contain a C-terminal PrLD, and mutations in the PrLD are associated with several diseases. Here, we show that the C. elegans TIAR-2/TIA protein functions cell autonomously to inhibit axon regeneration. TIAR-2 undergoes liquid-liquid phase separation in vitro and forms granules with liquid-like properties in vivo. Axon injury induces a transient increase in TIAR-2 granule number. The PrLD is necessary and sufficient for granule formation and inhibiting regeneration. Tyrosine residues within the PrLD are important for granule formation and inhibition of regeneration. TIAR-2 is also serine phosphorylated in vivo. Non-phosphorylatable TIAR-2 variants do not form granules and are unable to inhibit axon regeneration. Our data demonstrate an in vivo function for phase-separated TIAR-2 and identify features critical for its function in axon regeneration.

Asymmetric ephaptic inhibition between compartmentalized olfactory receptor neurons. Hartzell AL, Martyniuk KM, Zhang Y, Tsang TK, Bushong EA, Chu L, Chiang A, Ellisman MH, Reingruber J, Su C. Nature Communications. 201910. doi:10.1101/427252

In the Drosophila antenna, different subtypes of olfactory receptor neurons (ORNs) housed in the same sensory hair (sensillum) can inhibit each other non-synaptically. However, the mechanisms underlying this underexplored form of lateral inhibition remain unclear. Here we use recordings from pairs of sensilla impaled by the same tungsten electrode to demonstrate that direct electrical (“ephaptic”) interactions mediate lateral inhibition between ORNs. Intriguingly, within individual sensilla, we find that ephaptic lateral inhibition is asymmetric such that one ORN exerts greater influence onto its neighbor. Serial block-face scanning electron microscopy of genetically identified ORNs and circuit modeling indicate that asymmetric lateral inhibition reflects a surprisingly simple mechanism: the physically larger ORN in a pair corresponds to the dominant neuron in ephaptic interactions. Thus, morphometric differences between compartmentalized ORNs account for highly specialized inhibitory interactions that govern information processing at the earliest stages of olfactory coding.

Experience-dependent expression of immediate-early gene transcription factors (IEG-TFs) can transiently change the transcriptome of active neurons and initiate persistent changes in cellular function. However, the impact of IEG-TFs on circuit connectivity and function is poorly understood. We investigate the specificity with which the IEG-TF NPAS4 governs experience-dependent changes in inhibitory synaptic input onto CA1 pyramidal neurons (PNs). We show that novel sensory experience selectively enhances somatic inhibition mediated by cholecystokinin-expressing basket cells (CCKBCs) in an NPAS4-dependent manner. NPAS4 specifically increases the number of synapses made onto PNs by individual CCKBCs without altering synaptic properties. Additionally, we find that sensory experience-driven NPAS4 expression enhances depolarization-induced suppression of inhibition (DSI), a short-term form of cannabinoid-mediated plasticity expressed at CCKBC synapses. Our results indicate that CCKBC inputs are a major target of the NPAS4-dependent transcriptional program in PNs and that NPAS4 is an important regulator of plasticity mediated by endogenous cannabinoids.

ANKRD16 prevents neuron loss caused by an editing-defective tRNA synthetase. My-Nuong Vo, Markus Terrey, Jeong Woong Lee, Bappaditya Roy, James J. Moresco, Litao Sun, Hongjun Fu, Qi Liu, Thomas G. Weber, John R. Yates III, Kurt Fredrick, Paul Schimmel & Susan L. Ackerman. Neuron. May 16, 2018. doi:10.1038/s41586-018-0137-8.

Editing domains of aminoacyl tRNA synthetases correct tRNA charging errors to maintain translational fidelity. A mutation in the editing domain of alanyl tRNA synthetase (AlaRS) in Aarssti mutant mice results in an increase in the production of serine-mischarged tRNAAla and the degeneration of cerebellar Purkinje cells. Here, using positional cloning, we identified Ankrd16, a gene that acts epistatically with the Aarssti mutation to attenuate neurodegeneration. ANKRD16, a vertebrate-specific protein that contains ankyrin repeats, binds directly to the catalytic domain of AlaRS. Serine that is misactivated by AlaRS is captured by the lysine side chains of ANKRD16, which prevents the charging of serine adenylates to tRNAAla and precludes serine misincorporation in nascent peptides. The deletion of Ankrd16 in the brains of Aarssti/sti mice causes widespread protein aggregation and neuron loss. These results identify an amino-acid-accepting co-regulator of tRNA synthetase editing as a new layer of the machinery that is essential to the prevention of severe pathologies that arise from defects in editing.

Complex spatial working memory tasks have been shown to require both hippocampal sharp-wave ripple (SWR) activity and dentate gyrus (DG) neuronal activity. We therefore asked whether DG inputs to CA3 contribute to spatial working memory by promoting SWR generation. Recordings from DG and CA3 while rats performed a dentate-dependent working memory task on an eight-arm radial maze revealed that the activity of dentate neurons and the incidence rate of SWRs both increased during reward consumption. We then found reduced reward-related CA3 SWR generation without direct input from dentate granule neurons. Furthermore, CA3 cells with place fields in not-yet-visited arms preferentially fired during SWRs at reward locations, and these prospective CA3 firing patterns were more pronounced for correct trials and were dentate-dependent. These results indicate that coordination of CA3 neuronal activity patterns by DG is necessary for the generation of neuronal firing patterns that support goal-directed behavior and memory.

Drd3 Signaling in the Lateral Septum Mediates Early Life Stress-Induced Social Dysfunction. Sora Shin, Horia Pribiag, Varoth Lilascharoen, Daniel Knowland, Xiao-Yun Wang, Byung Kook Lim. Neuron. December 21, 2017. doi: 10.1016/j.neuron.2017.11.040.

Early life stress (ELS) in the form of child abuse/neglect is associated with an increased risk of developing social dysfunction in adulthood. Little is known, however, about the neural substrates or the neuromodulatory signaling that govern ELS-induced social dysfunction. Here, we show that ELS-induced downregulation of dopamine receptor 3 (Drd3) signaling and its corresponding effects on neural activity in the lateral septum (LS) are both necessary and sufficient to cause social abnormalities in adulthood. Utilizando in vivo Ca 2+ imaging, we found that Drd3-expressing-LS (Drd3 LS ) neurons in animals exposed to ELS show blunted activity in response to social stimuli. In addition, optogenetic activation of Drd3 LS neurons rescues ELS-induced social impairments. Furthermore, pharmacological treatment with a Drd3 agonist, which increases Drd3 LS neuronal activity, normalizes the social dysfunctions of ELS mice. Thus, we identify Drd3 in the LS as a critical mediator and potential therapeutic target for the social abnormalities caused by ELS.

Neurotransmitter Switching Regulated by miRNAs Controls Changes in Social Preference. Dulcis D, Lippi G, Stark CJ, Do LH, Berg DK, Spitzer NC. Neuron. 2017 Sep 1395(6):1319-1333.e5. doi: 10.1016/j.neuron.2017.08.023. Epub 2017 Aug 31.

Changes in social preference of amphibian larvae result from sustained exposure to kinship odorants. To understand the molecular and cellular mechanisms of this neuroplasticity, we investigated the effects of olfactory system activation on neurotransmitter (NT) expression in accessory olfactory bulb (AOB) interneurons during development. We show that protracted exposure to kin or non-kin odorants changes the number of dopamine (DA)- or gamma aminobutyric acid (GABA)-expressing neurons, with corresponding changes in attraction/aversion behavior. Changing the relative number of dopaminergic and GABAergic AOB interneurons or locally introducing DA or GABA receptor antagonists alters kinship preference. We then isolate AOB microRNAs (miRs) differentially regulated across these conditions. Inhibition of miR-375 and miR-200b reveals that they target Pax6 and Bcl11b to regulate the dopaminergic and GABAergic phenotypes. The results illuminate the role of NT switching governing experience-dependent social preference.

Activity-dependent trafficking of lysosomes in dendrites and dendritic spines. Goo MS, Sancho L, Slepak N, Boassa D, Deerinck TJ, Ellisman MH, Bloodgood BL, Patrick GN. J Cell Biol. 2017 Aug 7216(8):2499-2513. doi: 10.1083/jcb.201704068. Epub 2017 Jun 19.

In neurons, lysosomes, which degrade membrane and cytoplasmic components, are thought to primarily reside in somatic and axonal compartments, but there is little understanding of their distribution and function in dendrites. Here, we used conventional and two-photon imaging and electron microscopy to show that lysosomes traffic bidirectionally in dendrites and are present in dendritic spines. We find that lysosome inhibition alters their mobility and also decreases dendritic spine number. Furthermore, perturbing microtubule and actin cytoskeletal dynamics has an inverse relationship on the distribution and motility of lysosomes in dendrites. We also find trafficking of lysosomes is correlated with synaptic α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid-type glutamate receptors. Strikingly, lysosomes traffic to dendritic spines in an activity-dependent manner and can be recruited to individual spines in response to local activation. These data indicate the position of lysosomes is regulated by synaptic activity and thus plays an instructive role in the turnover of synaptic membrane proteins.

Microtubule-dependent ribosome localization in C. elegans neurons. Noma K, Goncharov A, Ellisman MH, Jin Y. Elife. 2017 Aug 26. pii: e26376. doi: 10.7554/eLife.26376.

Subcellular localization of ribosomes defines the location and capacity for protein synthesis. Methods for in vivo visualizing ribosomes in multicellular organisms are desirable in mechanistic investigations of the cell biology of ribosome dynamics. Here, we developed an approach using split GFP for tissue-specific visualization of ribosomes in Caenorhabditis elegans. Labeled ribosomes are detected as fluorescent puncta in the axons and synaptic terminals of specific neuron types, correlating with ribosome distribution at the ultrastructural level. We found that axonal ribosomes change localization during neuronal development and after axonal injury. By examining mutants affecting axonal trafficking and performing a forward genetic screen, we showed that the microtubule cytoskeleton and the JIP3 protein UNC-16 exert distinct effects on localization of axonal and somatic ribosomes. Our data demonstrate the utility of tissue-specific visualization of ribosomes in vivo, and provide insight into the mechanisms of active regulation of ribosome localization in neurons.

Reorganization of corticospinal output during motor learning. Peters AJ, Lee J, Hedrick NG, O'Neil K, Komiyama T. Nat Neurosci. 2017 Aug20(8):1133-1141. doi: 10.1038/nn.4596. Epub 2017 Jul 3.

Motor learning is accompanied by widespread changes within the motor cortex, but it is unknown whether these changes are ultimately funneled through a stable corticospinal output channel or whether the corticospinal output itself is plastic. We investigated the consistency of the relationship between corticospinal neuron activity and movement through in vivo two-photon calcium imaging in mice learning a lever-press task. Corticospinal neurons exhibited heterogeneous correlations with movement, with the majority of movement-modulated neurons decreasing activity during movement. Individual cells changed their activity across days, which led to changed associations between corticospinal activity and movement. Unlike previous observations in layer 2/3, activity accompanying learned movements did not become more consistent with learning instead, the activity of dissimilar movements became more decorrelated. These results indicate that the relationship between corticospinal activity and movement is dynamic and that the types of activity and plasticity are different from and possibly complementary to those in layer 2/3.

Distinct Ventral Pallidal Neural Populations Mediate Separate Symptoms of Depression. Knowland D, Lilascharoen V, Pacia CP, Shin S, Wang EH, Lim BK. Celda. 2017 Jul 13170(2):284-297.e18. doi: 10.1016/j.cell.2017.06.015. Epub 2017 Jul 6.

Major depressive disorder (MDD) patients display a common but often variable set of symptoms making successful, sustained treatment difficult to achieve. Separate depressive symptoms may be encoded by differential changes in distinct circuits in the brain, yet how discrete circuits underlie behavioral subsets of depression and how they adapt in response to stress has not been addressed. We identify two discrete circuits of parvalbumin-positive (PV) neurons in the ventral pallidum (VP) projecting to either the lateral habenula or ventral tegmental area contributing to depression. We find that these populations undergo different electrophysiological adaptations in response to social defeat stress, which are normalized by antidepressant treatment. Furthermore, manipulation of each population mediates either social withdrawal or behavioral despair, but not both. We propose that distinct components of the VP PV circuit can subserve related, yet separate depressive-like phenotypes in mice, which could ultimately provide a platform for symptom-specific treatments of depression.

Hormonal Modulation of Pheromone Detection Enhances Male Courtship Success Lin HH, Cao DS, Sethi S, Zeng Z, Chin JS, Chakraborty TS, Shepherd AK, Nguyen CA, Yew JY, Su CY, Wang JW. Neuron. 2016 Jun 1590(6):1272-85. doi: 10.1016/j.neuron.2016.05.004.

During the lifespans of most animals, reproductive maturity and mating activity are highly coordinated. In Drosophila melanogaster, for instance, male fertility increases with age, and older males are known to have a copulation advantage over young ones. The molecular and neural basis of this age-related disparity in mating behavior is unknown. Here, we show that the Or47b odorant receptor is required for the copulation advantage of older males. Notably, the sensitivity of Or47b neurons to a stimulatory pheromone, palmitoleic acid, is low in young males but high in older ones, which accounts for older males' higher courtship intensity. Mechanistically, this age-related sensitization of Or47b neurons requires a reproductive hormone, juvenile hormone, as well as its binding protein Methoprene-tolerant in Or47b neurons. Together, our study identifies a direct neural substrate for juvenile hormone that permits coordination of courtship activity with reproductive maturity to maximize male reproductive fitness. Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

Ryk controls remapping of motor cortex during functional recovery after spinal cord injury. Edmund R. Hollis, II, Nao Ishiko, Ting Yu, Chin-Chun Lu, Ariela Haimovich, Kristine Tolentino, Alisha Richman, Anna Tury, Shih-Hsiu Wang, Maysam Pessian, Euna Jo, Alex Kolodkin, Yimin Zou. Nature Neurosci. 2016 May19(5):697-705.

Limited functional recovery can be achieved with rehabilitation after incomplete spinal cord injury. Eliminating the function of a repulsive Wnt receptor, Ryk, by either conditional knockout in the motor cortex or monoclonal antibody infusion, resulted in increased corticospinal axon collateral branches with pre-synaptic puncta in the spinal cord and enhanced recovery of forelimb reaching and grasping function following a cervical dorsal column lesion. Using optical stimulation, we observed that motor cortical output maps underwent massive changes after injury and the hindlimb cortical areas were recruited to control the forelimb over time. Furthermore, a greater cortical area was dedicated to control the forelimb in Ryk cKO. In the absence of weekly task-specific training, recruitment of ectopic cortical areas was greatly reduced without significant functional recovery even in Ryk cKO. Our study provides evidence that maximal circuit reorganization and functional recovery can be achieved by combining molecular manipulation and task-specific training.

Hierarchy of orofacial rhythms revealed through whisking and breathing. Moore JD, Deschênes M, Furuta T, Huber D, Smear MC, Demers M, Kleinfeld D. Nature. 2013 May 9497(7448):205-10. doi: 10.1038/nature12076. Epub 2013 Apr 28.

Whisking and sniffing are predominant aspects of exploratory behaviour in rodents. Yet the neural mechanisms that generate and coordinate these and other orofacial motor patterns remain largely uncharacterized. Here we use anatomical, behavioural, electrophysiological and pharmacological tools to show that whisking and sniffing are coordinated by respiratory centres in the ventral medulla. We delineate a distinct region in the ventral medulla that provides rhythmic input to the facial motor neurons that drive protraction of the vibrissae. Neuronal output from this region is reset at each inspiration by direct input from the pre-Bötzinger complex, such that high-frequency sniffing has a one-to-one relationship with whisking, whereas basal respiration is accompanied by intervening whisks that occur between breaths. We conjecture that the respiratory nuclei, which project to other premotor regions for oral and facial control, function as a master clock for behaviours that coordinate with breathing.

How are sensory representations in the brain influenced by the state of an animal? Here we use chronic two-photon calcium imaging to explore how wakefulness and experience shape odor representations in the mouse olfactory bulb. Comparing the awake and anesthetized state, we show that wakefulness greatly enhances the activity of inhibitory granule cells and makes principal mitral cell odor responses more sparse and temporally dynamic. In awake mice, brief repeated odor experience leads to a gradual and long-lasting (months) weakening of mitral cell odor representations. This mitral cell plasticity is odor specific, recovers gradually over months, and can be repeated with different odors. Furthermore, the expression of this experience-dependent plasticity is prevented by anesthesia. Together, our results demonstrate the dynamic nature of mitral cell odor representations in awake animals, which is constantly shaped by recent odor experience.

Copyright © 2012 Elsevier Inc. All rights reserved.

MAPKKK dual leucine zipper-bearing kinases (DLKs) are regulators of synaptic development and axon regeneration. The mechanisms underlying their activation are not fully understood. Here, we show that C. elegans DLK-1 is activated by a Ca(2+)-dependent switch from inactive heteromeric to active homomeric protein complexes. We identify a DLK-1 isoform, DLK-1S, that shares identical kinase and leucine zipper domains with the previously described long isoform DLK-1L but acts to inhibit DLK-1 function by binding to DLK-1L. The switch between homo- or heteromeric DLK-1 complexes is influenced by Ca(2+) concentration. A conserved hexapeptide in the DLK-1L C terminus is essential for DLK-1 activity and is required for Ca(2+) regulation. The mammalian DLK-1 homolog MAP3K13 contains an identical C-terminal hexapeptide and can functionally complement dlk-1 mutants, suggesting that the DLK activation mechanism is conserved. The DLK activation mechanism is ideally suited for rapid and spatially controlled signal transduction in response to axonal injury and synaptic activity.

Copyright © 2012 Elsevier Inc. All rights reserved.

Grid cells in parahippocampal cortices fire at vertices of a periodic triangular grid that spans the entire recording environment. Such precise neural computations in space have been proposed to emerge from equally precise temporal oscillations within cells or within the local neural circuitry. We found that grid-like firing patterns in the entorhinal cortex vanished when theta oscillations were reduced after intraseptal lidocaine infusions in rats. Other spatially modulated cells in the same cortical region and place cells in the hippocampus retained their spatial firing patterns to a larger extent during these periods without well-organized oscillatory neuronal activity. Precisely timed neural activity within single cells or local networks is thus required for periodic spatial firing but not for single place fields.

PMID: 21458672 [PubMed - in process]

Internal physiological states influence behavioral decisions. We have investigated the underlying cellular and molecular mechanisms at the first olfactory synapse for starvation modulation of food-search behavior in Drosophila. We found that a local signal by short neuropeptide F (sNPF) and a global metabolic cue by insulin are integrated at specific odorant receptor neurons (ORNs) to modulate olfactory sensitivity. Results from two-photon calcium imaging show that starvation increases presynaptic activity via intraglomerular sNPF signaling. Expression of sNPF and its receptor (sNPFR1) in Or42b neurons is necessary for starvation-induced food-search behavior. Presynaptic facilitation in Or42b neurons is sufficient to mimic starvation-like behavior in fed flies. Furthermore, starvation elevates the transcription level of sNPFR1 but not that of sNPF, and insulin signaling suppresses sNPFR1 expression. Thus, starvation increases expression of sNPFR1 to change the odor map, resulting in more robust food-search behavior.

PMID: 21458672 [PubMed - in process]

The cerebral cortex constructs a coherent representation of the world by integrating distinct features of the sensory environment. Although these features are processed vertically across cortical layers, horizontal projections interconnecting neighbouring cortical domains allow these features to be processed in a context-dependent manner. Despite the wealth of physiological and psychophysical studies addressing the function of horizontal projections, how they coordinate activity among cortical domains remains poorly understood. We addressed this question by selectively activating horizontal projection neurons in mouse somatosensory cortex, and determined how the resulting spatial pattern of excitation and inhibition affects cortical activity. We found that horizontal projections suppress superficial layers while simultaneously activating deeper cortical output layers. This layer-specific modulation does not result from a spatial separation of excitation and inhibition, but from a layer-specific ratio between these two opposing conductances. Through this mechanism, cortical domains exploit horizontal projections to compete for cortical space.


Ver el vídeo: #επιστήμη Βιολογική ή συμβατική διατροφή: ποια είναι καλύτερη. idea loading (Julio 2022).


Comentarios:

  1. Shakajas

    Absolutamente no estoy de acuerdo

  2. Beceere

    Sí, de hecho. Sucede. Discutamos este tema.

  3. Husam

    En mi opinión, estás equivocado. Puedo defender mi posición. Envíeme un correo electrónico a PM.

  4. Yozshuzshura

    Solo sé así))

  5. Yardly

    la frase admirable y es oportuna



Escribe un mensaje